Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN5AQ14524 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
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