Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM25Q14258 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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