Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
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