Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE1CQ14123 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE1CQ14123 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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