Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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COL4A6Q14031 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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COL4A6Q14031 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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COL4A6Q14031 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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COL4A6Q14031 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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