Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF9Q13886 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms