Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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TUBA3CQ13748 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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