Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
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