Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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