Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NAE1Q13564 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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