Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BFSP2Q13515 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
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