Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
TRDNQ13061 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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