Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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