Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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