Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN13Q12923 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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