Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STX4Q12846 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STX4Q12846 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STX4Q12846 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STX4Q12846 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STX4Q12846 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STX4Q12846 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STX4Q12846 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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STX4Q12846 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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STX4Q12846 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
STX4Q12846 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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STX4Q12846 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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STX4Q12846 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STX4Q12846 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STX4Q12846 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STX4Q12846 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STX4Q12846 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STX4Q12846 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STX4Q12846 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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STX4Q12846 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STX4Q12846 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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STX4Q12846 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STX4Q12846 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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STX4Q12846 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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STX4Q12846 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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STX4Q12846 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STX4Q12846 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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STX4Q12846 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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STX4Q12846 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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STX4Q12846 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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STX4Q12846 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
STX4Q12846 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
STX4Q12846 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STX4Q12846 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
STX4Q12846 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
STX4Q12846 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STX4Q12846 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STX4Q12846 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STX4Q12846 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STX4Q12846 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STX4Q12846 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STX4Q12846 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
STX4Q12846 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
STX4Q12846 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
STX4Q12846 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STX4Q12846 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
STX4Q12846 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
STX4Q12846 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STX4Q12846 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STX4Q12846 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
STX4Q12846 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STX4Q12846 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STX4Q12846 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STX4Q12846 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STX4Q12846 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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