Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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