Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 MED1YPR070W 1701 nt2.2□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 NMA111YNL123W 2994 nt2.19□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YJL132WYJL132W 2253 nt2.19□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 PDR1YGL013C 3207 nt2.19□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 BUD30YDL151C 582 nt2.19□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 PBA1YLR199C 831 nt2.19□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YOR283WYOR283W 693 nt2.19□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 AEP2YMR282C 1743 nt2.19□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YDL199CYDL199C 2064 nt2.19□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 MTL1YGR023W 1656 nt2.18□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 BNI1YNL271C 5862 nt2.18□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 DNF1YER166W 4716 nt2.18□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 SSN2YDR443C 4263 nt2.18□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 TGL2YDR058C 981 nt2.18□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YDR535CYDR535C 501 nt2.18□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 RNR2YJL026W 1200 nt2.18□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YKL066WYKL066W 444 nt2.18□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 ALG14YBR070C 714 nt2.18□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 EBS1YDR206W 2655 nt2.18□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 STH1YIL126W 4080 nt2.17□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 SIP3YNL257C 3690 nt2.17□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 PDR3YBL005W 2931 nt2.17□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YRB1YDR002W 606 nt2.17□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 SPO74YGL170C 1242 nt2.17□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YGR015CYGR015C 987 nt2.17□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 ERG25YGR060W 930 nt2.17□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 COG2YGR120C 789 nt2.17□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YAP5YIR018W 738 nt2.17□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YLR257WYLR257W 966 nt2.17□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.17□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 GAS2YLR343W 1668 nt2.17□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 CIN1YOR349W 3045 nt2.17□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YDR186CYDR186C 2634 nt2.17□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 STE11YLR362W 2154 nt2.16□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 UBX3YDL091C 1368 nt2.16□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YFH1YDL120W 525 nt2.16□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.16□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 PEX18YHR160C 852 nt2.16□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 PAU23YLR037C 375 nt2.16□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YBL029WYBL029W 1131 nt2.16□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 PRM2YIL037C 1971 nt2.16□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 RPN3YER021W 1572 nt2.15□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YVC1YOR087W 2028 nt2.15□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 KHA1YJL094C 2622 nt2.15□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 APC11YDL008W 498 nt2.15□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 YIR043CYIR043C 693 nt2.15□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 SFH5YJL145W 885 nt2.15□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 CDA2YLR308W 939 nt2.15□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 TMA10YLR327C 261 nt2.15□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 ATG17YLR423C 1254 nt2.15□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 REC114YMR133W 1287 nt2.15□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 RGA1YOR127W 3024 nt2.15□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 RPN5YDL147W 1338 nt2.15□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 SGS1YMR190C 4344 nt2.14□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 MPS2YGL075C 1164 nt2.14□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 YHR213WYHR213W 597 nt2.14□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 YAR062WYAR062W 597 nt2.14□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 AIM32YML050W 936 nt2.14□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 YNL109WYNL109W 546 nt2.14□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 RPB8YOR224C 441 nt2.14□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 ARO7YPR060C 771 nt2.14□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 YBR242WYBR242W 717 nt2.14□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 KAP123YER110C 3342 nt2.14□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 VPS41YDR080W 2979 nt2.13□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 RRP8YDR083W 1179 nt2.13□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 RPB9YGL070C 369 nt2.13□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 EFG1YGR271C-A 702 nt2.13□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 PET130YJL023C 1044 nt2.13□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 PET191YJR034W 327 nt2.13□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 EMC6YLL014W 327 nt2.13□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 HMT1YBR034C 1047 nt2.13□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 ISU1YPL135W 498 nt2.13□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt2.13□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 SSD1YDR293C 3753 nt2.13□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 IRA2YOL081W 9240 nt2.12□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.12□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 HNT3YOR258W 654 nt2.12□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 USV1YPL230W 1176 nt2.12□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 YCK2YNL154C 1641 nt2.12□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 HRD1YOL013C 1656 nt2.12□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 VHR1YIL056W 1923 nt2.11□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 SAP185YJL098W 3177 nt2.11□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 SMT3YDR510W 306 nt2.11□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 YGR053CYGR053C 852 nt2.11□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt2.11□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 SPO16YHR153C 597 nt2.11□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 AYR1YIL124W 894 nt2.11□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 YLL044WYLL044W 447 nt2.11□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 AAH1YNL141W 1044 nt2.11□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 MBA1YBR185C 837 nt2.11□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 PTP3YER075C 2787 nt2.11□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 SPP41YDR464W 4308 nt2.11□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 KSP1YHR082C 3090 nt2.11□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 YCR064CYCR064C 411 nt2.1□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 COS7YDL248W 1152 nt2.1□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 RPC11YDR045C 333 nt2.1□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 PRP18YGR006W 756 nt2.1□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 YGR111WYGR111W 1203 nt2.1□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 OTU2YHL013C 924 nt2.1□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 COS5YJR161C 1152 nt2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.2 ms