Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 AIM11YER093C-A 414 nt3.05□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt3.05□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YGR039WYGR039W 312 nt3.05□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YGR107WYGR107W 450 nt3.05□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt3.05□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 GCD14YJL125C 1152 nt3.05□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 SWD2YKL018W 990 nt3.05□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 ATG5YPL149W 885 nt3.05□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 DUN1YDL101C 1542 nt3.04□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 MDM10YAL010C 1482 nt3.04□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 SPP382YLR424W 2127 nt3.04□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YFL051CYFL051C 483 nt3.04□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 SOL3YHR163W 750 nt3.04□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 PPX1YHR201C 1194 nt3.04□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 ENV10YLR065C 546 nt3.04□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 GLO1YML004C 981 nt3.04□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 ICS2YBR157C 768 nt3.04□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 MRPL27YBR282W 441 nt3.04□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 HEH2YDR458C 1992 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YJR061WYJR061W 2808 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 RDS2YPL133C 1341 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 RRP42YDL111C 798 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 RPL35BYDL136W 363 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 PPH3YDR075W 927 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 HTA1YDR225W 399 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 APA2YDR530C 978 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 GEP7YGL057C 864 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 CUP1-1YHR053C 186 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 CUP1-2YHR055C 186 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 APC9YLR102C 798 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 RPN13YLR421C 471 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 TRM112YNR046W 408 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 DCP1YOL149W 696 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 UFE1YOR075W 1041 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 SYC1YOR179C 567 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 RPL20BYOR312C 519 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 DIM1YPL266W 957 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 PEX34YCL056C 435 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 BUD4YJR092W 4344 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 TAO3YIL129C 7131 nt3.03□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 PKP2YGL059W 1476 nt3.03□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 PRP8YHR165C 7242 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 RCY1YJL204C 2523 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 GCD6YDR211W 2139 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 MET5YJR137C 4329 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 EXO84YBR102C 2262 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 PEX14YGL153W 1026 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 TAN1YGL232W 870 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YKL091CYKL091C 933 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 CMC1YKL137W 336 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 UNG1YML021C 1080 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YML094C-AYML094C-A 402 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 CSM3YMR048W 954 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YNL109WYNL109W 546 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 RSM19YNR037C 276 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 DRS2YAL026C 4068 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 MTL1YGR023W 1656 nt3.01□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 ROG1YGL144C 2058 nt3.01□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YDR442WYDR442W 393 nt3.01□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YEL075CYEL075C 369 nt3.01□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 POL32YJR043C 1053 nt3.01□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 BOS1YLR078C 735 nt3.01□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 SFH1YLR321C 1281 nt3.01□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YNL035CYNL035C 1170 nt3.01□□□□□ -1.93
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LDB17Q12342 TPK2YPL203W 1143 nt3.01□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 ARO4YBR249C 1113 nt3.01□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 APA1YCL050C 966 nt3.01□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 CIK1YMR198W 1785 nt3.01□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 NMD2YHR077C 3270 nt3.01□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 RRM3YHR031C 2172 nt3.01□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 KAP104YBR017C 2757 nt3□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 PSK1YAL017W 4071 nt3□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 ART10YLR392C 1557 nt3□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 THO1YER063W 657 nt3□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YGR064WYGR064W 369 nt3□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YGR114CYGR114C 390 nt3□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YGR190CYGR190C 366 nt3□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 QCR10YHR001W-A 234 nt3□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 DAL2YIR029W 1032 nt3□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 GLG2YJL137C 1143 nt3□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 VMA5YKL080W 1179 nt3□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 SEC14YMR079W 915 nt3□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 ATG34YOL083W 1239 nt3□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YOR062CYOR062C 807 nt3□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YBR013CYBR013C 390 nt3□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 TAF3YPL011C 1062 nt3□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 RED1YLR263W 2484 nt2.99□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 PDC2YDR081C 2778 nt2.99□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YCG1YDR325W 3108 nt2.99□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 TSC13YDL015C 933 nt2.99□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 RAD55YDR076W 1221 nt2.99□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YGL177WYGL177W 348 nt2.99□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 PFS1YHR185C 714 nt2.99□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YIL024CYIL024C 570 nt2.99□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 SDH3YKL141W 597 nt2.99□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.99□□□□□ -1.93
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