Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 YPL088WYPL088W 1029 nt3.67□□□□□ -1.82
HER1Q12276 RXT2YBR095C 1293 nt3.67□□□□□ -1.82
HER1Q12276 ARL1YBR164C 552 nt3.67□□□□□ -1.82
HER1Q12276 OSH3YHR073W 2991 nt3.67□□□□□ -1.82
HER1Q12276 ARP9YMR033W 1404 nt3.67□□□□□ -1.82
HER1Q12276 AEP2YMR282C 1743 nt3.67□□□□□ -1.82
HER1Q12276 GPI10YGL142C 1851 nt3.67□□□□□ -1.82
HER1Q12276 YNR065CYNR065C 3351 nt3.66□□□□□ -1.82
HER1Q12276 MFB1YDR219C 1398 nt3.66□□□□□ -1.82
HER1Q12276 SYT1YPR095C 3681 nt3.66□□□□□ -1.82
HER1Q12276 snR84snR84 550 nt3.66□□□□□ -1.82
HER1Q12276 YGL074CYGL074C 327 nt3.66□□□□□ -1.82
HER1Q12276 CCE1YKL011C 1062 nt3.66□□□□□ -1.82
HER1Q12276 SEN15YMR059W 387 nt3.66□□□□□ -1.82
HER1Q12276 TPM1YNL079C 600 nt3.66□□□□□ -1.82
HER1Q12276 YPL261CYPL261C 309 nt3.66□□□□□ -1.82
HER1Q12276 SPH1YLR313C 1593 nt3.66□□□□□ -1.82
HER1Q12276 ISM1YPL040C 3009 nt3.66□□□□□ -1.82
HER1Q12276 GSC2YGR032W 5688 nt3.66□□□□□ -1.82
HER1Q12276 YPR003CYPR003C 2265 nt3.65□□□□□ -1.82
HER1Q12276 UBX5YDR330W 1503 nt3.65□□□□□ -1.82
HER1Q12276 SSM4YIL030C 3960 nt3.65□□□□□ -1.82
HER1Q12276 COP1YDL145C 3606 nt3.65□□□□□ -1.82
HER1Q12276 TSC13YDL015C 933 nt3.65□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YDL228CYDL228C 642 nt3.65□□□□□ -1.83
HER1Q12276 DPP1YDR284C 870 nt3.65□□□□□ -1.83
HER1Q12276 APA2YDR530C 978 nt3.65□□□□□ -1.83
HER1Q12276 CNN1YFR046C 1086 nt3.65□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YIL161WYIL161W 708 nt3.65□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YJL114WYJL114W 681 nt3.65□□□□□ -1.83
HER1Q12276 VMA5YKL080W 1179 nt3.65□□□□□ -1.83
HER1Q12276 NIP7YPL211W 546 nt3.65□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt3.65□□□□□ -1.83
HER1Q12276 MRPS9YBR146W 837 nt3.65□□□□□ -1.83
HER1Q12276 CAF130YGR134W 3369 nt3.65□□□□□ -1.83
HER1Q12276 XRS2YDR369C 2565 nt3.65□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt3.65□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt3.65□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt3.65□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YCL020WYCL020W 1317 nt3.65□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YLR177WYLR177W 1887 nt3.64□□□□□ -1.83
HER1Q12276 LCB5YLR260W 2064 nt3.64□□□□□ -1.83
HER1Q12276 SDS23YGL056C 1584 nt3.64□□□□□ -1.83
HER1Q12276 ENP2YGR145W 2124 nt3.64□□□□□ -1.83
HER1Q12276 FAD1YDL045C 921 nt3.64□□□□□ -1.83
HER1Q12276 TMA20YER007C-A 546 nt3.64□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.64□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YHC1YLR298C 696 nt3.64□□□□□ -1.83
HER1Q12276 DIB1YPR082C 432 nt3.64□□□□□ -1.83
HER1Q12276 TRM82YDR165W 1335 nt3.64□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YPR148CYPR148C 1308 nt3.64□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YPR022CYPR022C 3402 nt3.64□□□□□ -1.83
HER1Q12276 RPO21YDL140C 5202 nt3.64□□□□□ -1.83
HER1Q12276 MRPL11YDL202W 750 nt3.63□□□□□ -1.83
HER1Q12276 VMA21YGR105W 234 nt3.63□□□□□ -1.83
HER1Q12276 GIM5YML094W 492 nt3.63□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YNL324WYNL324W 396 nt3.63□□□□□ -1.83
HER1Q12276 TOA1YOR194C 861 nt3.63□□□□□ -1.83
HER1Q12276 MRPL51YPR100W 423 nt3.63□□□□□ -1.83
HER1Q12276 RRG8YPR116W 834 nt3.63□□□□□ -1.83
HER1Q12276 SEC2YNL272C 2280 nt3.62□□□□□ -1.83
HER1Q12276 HDA2YDR295C 2025 nt3.62□□□□□ -1.83
HER1Q12276 CWC2YDL209C 1020 nt3.62□□□□□ -1.83
HER1Q12276 LRS4YDR439W 1044 nt3.62□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.62□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YER084W-AYER084W-A 513 nt3.62□□□□□ -1.83
HER1Q12276 RPS25AYGR027C 327 nt3.62□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt3.62□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YKR011CYKR011C 1062 nt3.62□□□□□ -1.83
HER1Q12276 TRM112YNR046W 408 nt3.62□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YOR082CYOR082C 342 nt3.62□□□□□ -1.83
HER1Q12276 CAF20YOR276W 486 nt3.62□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YOR387CYOR387C 621 nt3.62□□□□□ -1.83
HER1Q12276 NUP159YIL115C 4383 nt3.62□□□□□ -1.83
HER1Q12276 SUC2YIL162W 1599 nt3.62□□□□□ -1.83
HER1Q12276 RIM4YHL024W 2142 nt3.62□□□□□ -1.83
HER1Q12276 UBX3YDL091C 1368 nt3.62□□□□□ -1.83
HER1Q12276 NGG1YDR176W 2109 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 DAN4YJR151C 3486 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 SLU7YDR088C 1149 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YDR149CYDR149C 708 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YDR230WYDR230W 348 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 MAG1YER142C 891 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YJL175WYJL175W 513 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 ERP1YAR002C-A 660 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YMR310CYMR310C 954 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YNL122CYNL122C 348 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 PIN3YPR154W 648 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 STU1YBL034C 4542 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 SLF1YDR515W 1344 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 RGL1YPL066W 1440 nt3.61□□□□□ -1.83
HER1Q12276 AEP3YPL005W 1821 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 SEC59YMR013C 1560 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 CPA2YJR109C 3357 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 BSC2YDR275W 708 nt3.6□□□□□ -1.83
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