Protein–RNA interactions for Protein: Q12209

FRE8, Probable ferric reductase transmembrane component 8, yeastyeast

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FRE8Q12209 YOR203WYOR203W 354 nt2.82□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 VPS9YML097C 1356 nt2.82□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 POL2YNL262W 6669 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 GIS4YML006C 2325 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 OPI6YDL096C 327 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 DPP1YDR284C 870 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 PAU10YDR542W 363 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 PAU11YGL261C 363 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 YGR039WYGR039W 312 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 PAU13YHL046C 363 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 YKL091CYKL091C 933 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 SMD3YLR147C 306 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 YLR400WYLR400W 474 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 PAU4YLR461W 363 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 OST6YML019W 999 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 GOT1YMR292W 417 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 YOR238WYOR238W 912 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 ARO4YBR249C 1113 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 MSR1YHR091C 1932 nt2.81□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 IRC3YDR332W 2070 nt2.8□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 REC8YPR007C 2043 nt2.8□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 SHQ1YIL104C 1524 nt2.8□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 PEX10YDR265W 1014 nt2.8□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 YDR491CYDR491C 492 nt2.8□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 NNT1YLR285W 786 nt2.8□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 RPL19BYBL027W 570 nt2.8□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 DLT1YMR126C 1029 nt2.8□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 RPA43YOR340C 981 nt2.8□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 YPR053CYPR053C 456 nt2.8□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 STT4YLR305C 5703 nt2.8□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 RRM3YHR031C 2172 nt2.8□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 ENA5YDR038C 3276 nt2.8□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 EXO5YBR163W 1758 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 FAR1YJL157C 2493 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 TSC11YER093C 4293 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 IOC3YFR013W 2364 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 DRS2YAL026C 4068 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 YDL176WYDL176W 2127 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 ARF1YDL192W 546 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 YGL242CYGL242C 546 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 NNF1YJR112W 606 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 YKL131WYKL131W 522 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 RPL17AYKL180W 555 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 YAL064WYAL064W 285 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 YNL013CYNL013C 378 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 AAR2YBL074C 1068 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 MRPL17YNL252C 846 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 SIZ1YDR409W 2715 nt2.79□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 VTC4YJL012C 2166 nt2.78□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 KAP104YBR017C 2757 nt2.78□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 RTG3YBL103C 1461 nt2.78□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 COM2YER130C 1332 nt2.78□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 AI3Q0060 1248 nt2.78□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 NKP1YDR383C 717 nt2.78□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt2.78□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 GEP7YGL057C 864 nt2.78□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 YGL082WYGL082W 1146 nt2.78□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 BRR6YGL247W 594 nt2.78□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 RFA3YJL173C 369 nt2.78□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 RPL13BYMR142C 600 nt2.78□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 MIC27YNL100W 705 nt2.78□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 YNL184CYNL184C 327 nt2.78□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 CMD1YBR109C 444 nt2.78□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 ENP2YGR145W 2124 nt2.78□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 CIN1YOR349W 3045 nt2.78□□□□□ -1.96
FRE8Q12209 BEM4YPL161C 1902 nt2.78□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 RCY1YJL204C 2523 nt2.77□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 AIM11YER093C-A 414 nt2.77□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 RPL30YGL030W 318 nt2.77□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 AGE2YIL044C 897 nt2.77□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.77□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 RPN13YLR421C 471 nt2.77□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 YOR062CYOR062C 807 nt2.77□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 VBA4YDR119W 2307 nt2.77□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 BCH1YMR237W 2175 nt2.77□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 ARP4YJL081C 1470 nt2.77□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 NDC80YIL144W 2076 nt2.77□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 APC5YOR249C 2058 nt2.77□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 TFC1YBR123C 1950 nt2.76□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 SAD1YFR005C 1347 nt2.76□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 UBP5YER144C 2418 nt2.76□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 snR68snR68 136 nt2.76□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 YDL157CYDL157C 357 nt2.76□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 SRB7YDR308C 423 nt2.76□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 DYN2YDR424C 279 nt2.76□□□□□ -1.97
FRE8Q12209 COBQ0105 1158 nt2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.9 ms