Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 YAK1YJL141C 2424 nt3.3□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 VTC4YJL012C 2166 nt3.3□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt3.3□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 ENP2YGR145W 2124 nt3.3□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 CCE1YKL011C 1062 nt3.3□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 RPS21AYKR057W 264 nt3.3□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 YLR365WYLR365W 333 nt3.3□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 SSU72YNL222W 621 nt3.3□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 NDC80YIL144W 2076 nt3.3□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 LCB4YOR171C 1875 nt3.3□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 MAK11YKL021C 1407 nt3.29□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 CHA4YLR098C 1947 nt3.29□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 SRB7YDR308C 423 nt3.29□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 YEL010WYEL010W 351 nt3.29□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 YEL075CYEL075C 369 nt3.29□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 RGI2YIL057C 495 nt3.29□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 CMC1YKL137W 336 nt3.29□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 BET5YML077W 480 nt3.29□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 ENA5YDR038C 3276 nt3.29□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 ENA2YDR039C 3276 nt3.29□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 ENA1YDR040C 3276 nt3.29□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 AI4Q0065 1671 nt3.29□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 MIT1YEL007W 2001 nt3.29□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 IOC3YFR013W 2364 nt3.29□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 STE23YLR389C 3084 nt3.28□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 ROM1YGR070W 3468 nt3.28□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 CIN8YEL061C 3003 nt3.28□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 XRN1YGL173C 4587 nt3.28□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 PCI8YIL071C 1335 nt3.28□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 RPL24BYGR148C 468 nt3.28□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 YKL131WYKL131W 522 nt3.28□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 YBR053CYBR053C 1077 nt3.28□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 YPR053CYPR053C 456 nt3.28□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 VBA4YDR119W 2307 nt3.28□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 CIN1YOR349W 3045 nt3.28□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 CDC40YDR364C 1368 nt3.27□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 SIZ1YDR409W 2715 nt3.27□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 DPP1YDR284C 870 nt3.27□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.27□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.27□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 GEP7YGL057C 864 nt3.27□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YKR070WYKR070W 1059 nt3.27□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YMR141CYMR141C 309 nt3.27□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 ERG2YMR202W 669 nt3.27□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 RPB8YOR224C 441 nt3.27□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 ARP4YJL081C 1470 nt3.27□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 NTO1YPR031W 2247 nt3.27□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 TCP1YDR212W 1680 nt3.27□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 CDC5YMR001C 2118 nt3.26□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YDR491CYDR491C 492 nt3.26□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 RPL22BYFL034C-A 369 nt3.26□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 PEX14YGL153W 1026 nt3.26□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YGL204CYGL204C 306 nt3.26□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.26□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 RFA3YJL173C 369 nt3.26□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 GPN3YLR243W 819 nt3.26□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YLR339CYLR339C 552 nt3.26□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt3.26□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 DLT1YMR126C 1029 nt3.26□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.26□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YOR203WYOR203W 354 nt3.26□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 PFK26YIL107C 2484 nt3.26□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 EMP70YLR083C 2004 nt3.26□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 MDV1YJL112W 2145 nt3.25□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 APC5YOR249C 2058 nt3.25□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 BRR6YGL247W 594 nt3.25□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 SDP1YIL113W 630 nt3.25□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.25□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.25□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.25□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.25□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt3.25□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YBL062WYBL062W 381 nt3.25□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 HHF2YNL030W 312 nt3.25□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 TUM1YOR251C 915 nt3.25□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 PPT2YPL148C 522 nt3.25□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 APD1YBR151W 951 nt3.25□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 TFC1YBR123C 1950 nt3.25□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 UBP5YER144C 2418 nt3.24□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 MAK21YDR060W 3078 nt3.24□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 FLO5YHR211W 3228 nt3.24□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 POL2YNL262W 6669 nt3.24□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 STE6YKL209C 3873 nt3.24□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 PIB1YDR313C 861 nt3.24□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YGR107WYGR107W 450 nt3.24□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.24□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 NEJ1YLR265C 1029 nt3.24□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 MIC27YNL100W 705 nt3.24□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 AAR2YBL074C 1068 nt3.24□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 DCP1YOL149W 696 nt3.24□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 BCH1YMR237W 2175 nt3.24□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 PEX6YNL329C 3093 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 SLS1YLR139C 1932 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 TGL3YMR313C 1929 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 COBQ0105 1158 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 THO1YER063W 657 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 UPF3YGR072W 1164 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 RPA12YJR063W 378 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 AIM25YJR100C 984 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 NNF1YJR112W 606 nt3.23□□□□□ -1.89
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