Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms