Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPAL4Q0D2K0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms