Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms