Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM2AQ08AH3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM2AQ08AH3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM2AQ08AH3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM2AQ08AH3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM2AQ08AH3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM2AQ08AH3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM2AQ08AH3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM2AQ08AH3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms