Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSRP1Q08945 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms