Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms