Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LOXL1Q08397 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LOXL1Q08397 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LOXL1Q08397 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LOXL1Q08397 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL1Q08397 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL1Q08397 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL1Q08397 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms