Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GOLGA3Q08378 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms