Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TGM3Q08188 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms