Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms