Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR3Q06889 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms