Protein–RNA interactions for Protein: Q06682

UBX5, UBX domain-containing protein 5, yeast

Predictions only

Length 500 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX5	Q06682	PEX29	YDR479C	1665 nt		4.57	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	KIN4	YOR233W	2403 nt		4.57	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	RPS29B	YDL061C	171 nt		4.57	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	AHA1	YDR214W	1053 nt		4.57	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	TFB3	YDR460W	966 nt		4.57	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	SEC4	YFL005W	648 nt		4.57	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	RMR1	YGL250W	726 nt		4.57	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	YIL171W	YIL171W	330 nt		4.57	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	RPL17A	YKL180W	555 nt		4.57	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	YLR264C-A	YLR264C-A	117 nt		4.57	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	CBP3	YPL215W	1008 nt		4.57	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	YCL021W-A	YCL021W-A	378 nt		4.57	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	YLR152C	YLR152C	1731 nt		4.57	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	FRE4	YNR060W	2160 nt		4.57	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	NUG1	YER006W	1563 nt		4.57	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	HMLALPHA2	YCL067C	633 nt		4.56	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	MATALPHA2	YCR039C	633 nt		4.56	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	CGR1	YGL029W	363 nt		4.56	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	YGL063C-A	YGL063C-A	150 nt		4.56	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	YGR114C	YGR114C	390 nt		4.56	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	YHL048C-A	YHL048C-A	135 nt		4.56	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	BET4	YJL031C	984 nt		4.56	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	FLD1	YLR404W	858 nt		4.56	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	YPL035C	YPL035C	348 nt		4.56	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	YPL205C	YPL205C	345 nt		4.56	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	LCB5	YLR260W	2064 nt		4.56	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	THR4	YCR053W	1545 nt		4.56	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	LAS1	YKR063C	1509 nt		4.56	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	VIP1	YLR410W	3441 nt		4.56	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	PKP2	YGL059W	1476 nt		4.56	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	BRE4	YDL231C	3378 nt		4.55	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	snR9	snR9	187 nt		4.55	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	YDR320W-B	YDR320W-B	138 nt		4.55	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	BUD13	YGL174W	801 nt		4.55	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	INN1	YNL152W	1230 nt		4.55	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	BUD21	YOR078W	645 nt		4.55	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	PIN4	YBL051C	2007 nt		4.55	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	ARP5	YNL059C	2268 nt		4.55	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	YJL049W	YJL049W	1353 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	STE24	YJR117W	1362 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	VPS33	YLR396C	2076 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	CBS1	YDL069C	690 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	VAB2	YEL005C	849 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	tK(CUU)C	tK(CUU)C	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	tK(CUU)D1	tK(CUU)D1	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	tK(CUU)D2	tK(CUU)D2	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	tK(CUU)E1	tK(CUU)E1	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	tK(CUU)E2	tK(CUU)E2	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	tK(CUU)F	tK(CUU)F	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	tK(CUU)G1	tK(CUU)G1	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	tK(CUU)G2	tK(CUU)G2	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	tK(CUU)G3	tK(CUU)G3	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	tK(CUU)I	tK(CUU)I	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	tK(CUU)J	tK(CUU)J	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	tK(CUU)K	tK(CUU)K	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	tK(CUU)M	tK(CUU)M	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	tK(CUU)P	tK(CUU)P	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	RGI2	YIL057C	495 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	SNX4	YJL036W	1272 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	YJR157W	YJR157W	363 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	RPA43	YOR340C	981 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	SPC29	YPL124W	762 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	YPR145C-A	YPR145C-A	237 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	snR24	snR24	89 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	TDA1	YMR291W	1761 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	VBA2	YBR293W	1425 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	GLC3	YEL011W	2115 nt		4.54	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	VID22	YLR373C	2706 nt		4.53	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	HDA2	YDR295C	2025 nt		4.53	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	JJJ1	YNL227C	1773 nt		4.53	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	TRM82	YDR165W	1335 nt		4.53	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	FLO10	YKR102W	3510 nt		4.53	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	YDR089W	YDR089W	2610 nt		4.53	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	PBP4	YDL053C	558 nt		4.53	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	EMC2	YJR088C	879 nt		4.53	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	OCA2	YNL056W	594 nt		4.53	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	YNL122C	YNL122C	348 nt		4.53	□□□□□ -1.68
UBX5	Q06682	YCT1	YLL055W	1596 nt		4.53	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	MIS1	YBR084W	2928 nt		4.52	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	RRN11	YML043C	1524 nt		4.52	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	OTU1	YFL044C	906 nt		4.52	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	MNN11	YJL183W	1269 nt		4.52	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	ASC1	YMR116C	960 nt		4.52	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	YNL324W	YNL324W	396 nt		4.52	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	YRO2	YBR054W	1035 nt		4.52	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	snR17a	snR17a	333 nt		4.52	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	TMA108	YIL137C	2841 nt		4.52	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	KRE2	YDR483W	1329 nt		4.51	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	YOR022C	YOR022C	2148 nt		4.51	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	RPS14A	YCR031C	414 nt		4.51	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	YDR018C	YDR018C	1191 nt		4.51	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	TGL2	YDR058C	981 nt		4.51	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	YDR199W	YDR199W	366 nt		4.51	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	IES6	YEL044W	501 nt		4.51	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	MXR1	YER042W	555 nt		4.51	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	YHR050W-A	YHR050W-A	171 nt		4.51	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	ILM1	YJR118C	612 nt		4.51	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	SRP21	YKL122C	504 nt		4.51	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	UTP23	YOR004W	765 nt		4.51	□□□□□ -1.69
UBX5	Q06682	CUR1	YPR158W	759 nt		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.3 ms