Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EXOSC9Q06265 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms