Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms