Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CALD1Q05682 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CALD1Q05682 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CALD1Q05682 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CALD1Q05682 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CALD1Q05682 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CALD1Q05682 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALD1Q05682 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALD1Q05682 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CALD1Q05682 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALD1Q05682 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CALD1Q05682 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CALD1Q05682 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CALD1Q05682 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CALD1Q05682 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CALD1Q05682 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CALD1Q05682 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CALD1Q05682 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CALD1Q05682 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CALD1Q05682 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CALD1Q05682 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CALD1Q05682 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CALD1Q05682 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms