Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN12Q05209 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPN12Q05209 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms