Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms