Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt3.13□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 RPB8YOR224C 441 nt3.13□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 MYO5YMR109W 3660 nt3.13□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 DOA4YDR069C 2781 nt3.13□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 PTP3YER075C 2787 nt3.13□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 DYN1YKR054C 12279 nt3.13□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 RTT10YPL183C 3042 nt3.13□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 YPP1YGR198W 2454 nt3.13□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 MAK21YDR060W 3078 nt3.13□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 STE24YJR117W 1362 nt3.12□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 GIN4YDR507C 3429 nt3.12□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 TEC1YBR083W 1461 nt3.12□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 MST27YGL051W 705 nt3.12□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 LST7YGR057C 729 nt3.12□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 SAW1YAL027W 786 nt3.12□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 PFK27YOL136C 1194 nt3.12□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 UBP8YMR223W 1416 nt3.11□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 HUL5YGL141W 2733 nt3.11□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 SPT15YER148W 723 nt3.11□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 YHR213WYHR213W 597 nt3.11□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 RPS21BYJL136C 264 nt3.11□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 EMC2YJR088C 879 nt3.11□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 YLL047WYLL047W 384 nt3.11□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 YAR062WYAR062W 597 nt3.11□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 YBL065WYBL065W 345 nt3.11□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 BUD21YOR078W 645 nt3.11□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 snR43snR43 209 nt3.11□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 ECM29YHL030W 5607 nt3.11□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 MSH2YOL090W 2895 nt3.11□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 INP52YNL106C 3552 nt3.11□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 CAF120YNL278W 3183 nt3.1□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 NEW1YPL226W 3591 nt3.1□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 YDR222WYDR222W 1248 nt3.1□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 EPT1YHR123W 1176 nt3.1□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 SNX4YJL036W 1272 nt3.1□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 SPO20YMR017W 1194 nt3.1□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 snR11snR11 258 nt3.1□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt3.1□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 VPS3YDR495C 3036 nt3.1□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 TAF2YCR042C 4224 nt3.09□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 BUB1YGR188C 3066 nt3.09□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 YDL026WYDL026W 312 nt3.09□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 snR70snR70 164 nt3.09□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 EBP2YKL172W 1284 nt3.09□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 SSN8YNL025C 972 nt3.09□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 YBL096CYBL096C 309 nt3.09□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 IRC14YOR135C 342 nt3.09□□□□□ -1.91
CSI1Q04368 PLM2YDR501W 1566 nt3.08□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 DBP7YKR024C 2229 nt3.08□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 RPO41YFL036W 4056 nt3.08□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 DSS1YMR287C 2910 nt3.08□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 PMI40YER003C 1290 nt3.08□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 GPP2YER062C 753 nt3.08□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 YKR011CYKR011C 1062 nt3.08□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 RRD2YPL152W 1077 nt3.08□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 TAO3YIL129C 7131 nt3.08□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 YML096WYML096W 1578 nt3.08□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 PFF1YBR074W 2931 nt3.07□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.07□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 POP6YGR030C 477 nt3.07□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.07□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt3.07□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.07□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 AAH1YNL141W 1044 nt3.07□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 YOR050CYOR050C 348 nt3.07□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 ECM18YDR125C 1362 nt3.07□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 MOT1YPL082C 5604 nt3.07□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 DUN1YDL101C 1542 nt3.07□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 HFM1YGL251C 3564 nt3.07□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 VAC14YLR386W 2643 nt3.06□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 MON1YGL124C 1935 nt3.06□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 EMC6YLL014W 327 nt3.06□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 YNL184CYNL184C 327 nt3.06□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 MUM2YBR057C 1101 nt3.06□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 MRP2YPR166C 348 nt3.06□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 XRN1YGL173C 4587 nt3.05□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 FKS3YMR306W 5358 nt3.05□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 RDS2YPL133C 1341 nt3.05□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt3.05□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 MPC3YGR243W 441 nt3.05□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 UNG1YML021C 1080 nt3.05□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 RSM19YNR037C 276 nt3.05□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 YOR055WYOR055W 435 nt3.05□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 KAR4YCL055W 1008 nt3.05□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 RRM3YHR031C 2172 nt3.05□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 PDR3YBL005W 2931 nt3.05□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 SRO77YBL106C 3033 nt3.04□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 YDR186CYDR186C 2634 nt3.04□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 LRS4YDR439W 1044 nt3.04□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 RMT2YDR465C 1239 nt3.04□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 IZH1YDR492W 951 nt3.04□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 DDI2YFL061W 678 nt3.04□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 YGR190CYGR190C 366 nt3.04□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 LSM12YHR121W 564 nt3.04□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt3.04□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 DID4YKL002W 699 nt3.04□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 ENV10YLR065C 546 nt3.04□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 TEX1YNL253W 1269 nt3.04□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 YPL035CYPL035C 348 nt3.04□□□□□ -1.92
CSI1Q04368 GRX1YCL035C 333 nt3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.1 ms