Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN1Q04323 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms