Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms