Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP27A1Q02318 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms