Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms