Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CLTCQ00610 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms