Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms