Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
JAG1P78504 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
JAG1P78504 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
JAG1P78504 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
JAG1P78504 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
JAG1P78504 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
JAG1P78504 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
JAG1P78504 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
JAG1P78504 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
JAG1P78504 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
JAG1P78504 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JAG1P78504 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JAG1P78504 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JAG1P78504 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JAG1P78504 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JAG1P78504 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JAG1P78504 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
JAG1P78504 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
JAG1P78504 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JAG1P78504 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JAG1P78504 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JAG1P78504 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JAG1P78504 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JAG1P78504 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
JAG1P78504 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JAG1P78504 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JAG1P78504 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JAG1P78504 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JAG1P78504 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JAG1P78504 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JAG1P78504 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JAG1P78504 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JAG1P78504 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JAG1P78504 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JAG1P78504 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JAG1P78504 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JAG1P78504 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JAG1P78504 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
JAG1P78504 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JAG1P78504 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JAG1P78504 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
JAG1P78504 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
JAG1P78504 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
JAG1P78504 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
JAG1P78504 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
JAG1P78504 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
JAG1P78504 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
JAG1P78504 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
JAG1P78504 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
JAG1P78504 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
JAG1P78504 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
JAG1P78504 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
JAG1P78504 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
JAG1P78504 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
JAG1P78504 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
JAG1P78504 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JAG1P78504 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
JAG1P78504 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
JAG1P78504 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JAG1P78504 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JAG1P78504 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JAG1P78504 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
JAG1P78504 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JAG1P78504 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
JAG1P78504 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms