Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX3P78415 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX3P78415 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX3P78415 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX3P78415 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX3P78415 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX3P78415 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX3P78415 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX3P78415 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX3P78415 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX3P78415 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX3P78415 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX3P78415 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX3P78415 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX3P78415 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX3P78415 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX3P78415 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX3P78415 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX3P78415 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX3P78415 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX3P78415 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX3P78415 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX3P78415 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX3P78415 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX3P78415 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX3P78415 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX3P78415 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX3P78415 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX3P78415 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX3P78415 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX3P78415 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX3P78415 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX3P78415 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX3P78415 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX3P78415 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX3P78415 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX3P78415 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX3P78415 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX3P78415 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX3P78415 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX3P78415 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX3P78415 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX3P78415 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRX3P78415 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRX3P78415 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRX3P78415 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRX3P78415 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX3P78415 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX3P78415 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX3P78415 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX3P78415 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX3P78415 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX3P78415 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX3P78415 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX3P78415 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX3P78415 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX3P78415 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX3P78415 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX3P78415 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX3P78415 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX3P78415 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX3P78415 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX3P78415 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX3P78415 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX3P78415 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX3P78415 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX3P78415 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX3P78415 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX3P78415 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX3P78415 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX3P78415 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX3P78415 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX3P78415 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX3P78415 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX3P78415 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX3P78415 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX3P78415 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX3P78415 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX3P78415 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms