Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PITX1P78337 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PITX1P78337 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX1P78337 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX1P78337 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX1P78337 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX1P78337 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX1P78337 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX1P78337 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX1P78337 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX1P78337 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX1P78337 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX1P78337 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX1P78337 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX1P78337 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX1P78337 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX1P78337 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX1P78337 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX1P78337 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX1P78337 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX1P78337 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX1P78337 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX1P78337 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX1P78337 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX1P78337 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX1P78337 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX1P78337 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX1P78337 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX1P78337 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX1P78337 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX1P78337 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX1P78337 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX1P78337 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX1P78337 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX1P78337 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX1P78337 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX1P78337 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX1P78337 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX1P78337 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX1P78337 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX1P78337 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX1P78337 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX1P78337 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX1P78337 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX1P78337 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX1P78337 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX1P78337 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX1P78337 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX1P78337 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX1P78337 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX1P78337 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX1P78337 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX1P78337 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX1P78337 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX1P78337 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX1P78337 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX1P78337 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX1P78337 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX1P78337 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX1P78337 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX1P78337 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX1P78337 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX1P78337 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX1P78337 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX1P78337 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX1P78337 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX1P78337 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX1P78337 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX1P78337 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX1P78337 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX1P78337 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX1P78337 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX1P78337 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX1P78337 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX1P78337 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX1P78337 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX1P78337 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX1P78337 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX1P78337 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX1P78337 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PITX1P78337 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PITX1P78337 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX1P78337 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX1P78337 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX1P78337 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX1P78337 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX1P78337 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX1P78337 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX1P78337 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX1P78337 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX1P78337 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX1P78337 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX1P78337 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX1P78337 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX1P78337 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX1P78337 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PITX1P78337 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms