Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-16P61578 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms